山羊肌肉组织microRNA Solexa测序与生物信息学分析

来源 :畜牧兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:coralbird
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本研究旨在挖掘山羊肌肉组织miRNA,获取山羊肌肉组织miRNA表达谱并分析其生物学特征,为进一步研究特定miRNA参与山羊肌肉细胞的增殖与分化等生长发育机制奠定理论基础.从山羊肌肉组织中提取总RNA,分离、构建小片段RNA文库,利用Solexa方法进行测序并进行生物信息学分析,最后利用q-PCR技术验证miRNA在山羊肌肉组织中的表达情况.共鉴定出517个物种间保守的和2个山羊基因组特有的miRNA.其中306个表达量在100以上.随机选择8个miRNA,利用q-PCR验证其在山羊肌肉组织中的表达情况,结果与测序结果一致.同时miRNA靶基因预测和功能分析表明,很多miRNA可能影响一些与动物肌肉发育相关的细胞信号通路.测序成功获取了山羊肌肉组织miRNA序列及其表达谱,山羊肌肉组织miRNA表达丰富且表达量各异.本研究也为进一步研究miRNA调控哺乳动物肌肉发育奠定了理论基础.
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