【摘 要】
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为深入了解杜仲MEP途径基因5’端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5’端非编码区顺式作用元件的结构和功能。
【机 构】
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中国林业科学研究院经济林研究开发中心,国家林业局杜仲工程技术研究中心,中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,中南林业科技大学林学院
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为深入了解杜仲MEP途径基因5’端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5’端非编码区顺式作用元件的结构和功能。生物信息学分析表明:EuDXS2基因5’端非编码区预测出共有22种共220个顺式作用元件,其中包含启动子顺式元件145个TATA.box和39个CAAT-box的可能位点;EuDXR基因5’端非编码区预测出21种共127个顺式作用元件,68个TATA.box和32个CAAT-box;EuCMK基因5’端非编码区预测出24种共134个顺式
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