中国猪瘟兔化弱毒兔脾毒NS2-3基因的序列分析

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根据已发表的猪瘟病毒序列,设计并合成了覆盖有NS2-3全基因的4对引物,应用RT-PCR技术从接种了猪瘟兔化弱毒(hog cholera virus lapinized Chinese strain,HCLV)的兔脾组织中,成功地扩增了NS2-3基因,将其克隆到T载体后,测定了其核苷酸序列.结果显示,所克隆的NS2-3基因长2 964个核苷酸,编码988个氨基酸.用DNASIS和PROSIS软件分析表明,该基因具有丝氨酸类蛋白酶活性及含有解旋酶超家族特征性保守序列.核苷酸序列同源性分析表明,HCLV与国外报导的8株HCV毒株"C"、Riems、ALD、GPE、Glentorf、CAP、Brescia和Alfort株NS2-3基因核苷酸序列同源性分别为99%、99%、96%、96%、95%、95%、94%和86%,推导的氨基酸序列同源性分别为99%、99%、98%、98%、98%、97%、97%和95%,氨基酸序列的高度同源性表明了NS2-3是猪瘟病毒中高度保守的蛋白质之一,这与该基因产物参与病毒复制及多聚蛋白前体加工过程中的重要作用相对应.
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