用16SrDNA测序技术分析重症肺炎患者肠道菌群变化的特征。
方法采用前瞻性研究方法，收集2018年6月至12月住宁夏医科大学总医院重症医学科（ICU）16例重症肺炎患者入院2 d内自然排便或灌肠所得的粪便标本，以及10例健康体检者的粪便标本，采用16SrDNA测序技术对粪便菌群进行检测并进行生物学信息分析。
结果①对重症肺炎患者和健康者粪便样本进行16SrDNA测序共得到1 015 475条有效序列，样本序列平均有效长度为458.35 bp，总样本平均序列条数为39 056.73条。②肠道菌群α多样性分析显示，与健康对照组比较，重症肺炎组患者肠道菌丰度指数Ace指数、Chao指数及肠道菌群多样性指数Shannon指数显著下降〔Ace指数：167.23（143.14，211.26）比227.71（214.53，247.05），Chao指数：152.38（138.09，182.54）比228.25（215.49，248.95），Shannon指数：2.37（1.68，2.89）比3.39（3.03，3.63），均P<0.01〕，肠道菌群多样性指数Simpson指数显著升高〔0.21（0.11，0.33）比0.07（0.06，0.12），P<0.01〕，提示重症肺炎患者肠道菌群的丰度和多样性下降。③肠道菌群β多样性分析（采用主坐标分析）显示，健康对照组菌群结构相似度高，重症肺炎组菌群结构差异较大。Adonis分析显示，重症肺炎组与健康对照组菌群群落结构存在显著差异（R2＝0.061，P＝0.05）。④门水平差异菌分析显示，重症肺炎组厚壁菌门比例较健康对照组显著下降〔27.36（18.12，39.28）%比52.25（38.36，63.82）%，P＝0.02〕，而放线菌门、互养菌门和梭杆菌门的比例均较健康对照组明显增加〔2.30（0.30，4.80）%比0.02（0.00，0.06）%，0.36（<0.01，0.57）%比<0.01（<0.01，<0.01）%，0.01（<0.01，0.08）%比<0.01（<0.01，<0.01）%，均P<0.05〕。⑤属水平差异菌分析显示，重症肺炎组有益共生菌属双歧杆菌属、瘤胃球菌属、假丁酸弧菌属、粪球菌属、毛螺菌属、普氏菌属比例均较健康对照组显著下降〔0.18（0.01，0.25）%比3.40（0.46，5.78）%，0.01（<0.01，0.29）%比2.26（0.84，4.86）%，0.01（<0.01，0.02）%比2.73（1.87，5.74）%，0.02（<0.01，0.07）%比0.80（0.50，2.32）%，<0.01（<0.01，<0.01）%比0.88（0.33，2.08）%，0.02（<0.01，0.31）%比7.74（0.07，36.27）%，均P<0.05〕；机会性致病菌埃希杆菌属及致病菌肠球菌属比例较健康对照组升高，但差异无统计学意义〔2.00（0.57，10.23）%比1.16（0.23，2.68）%，0.02（<0.01，0.42）%比<0.01（<0.01，0.04）%，均P>0.05〕；而致病菌梭杆菌属、葡萄球菌属比例较健康对照组明显升高〔0.01（<0.01，0.08）%比<0.01（<0.01，<0.01）%，0.01（<0.01，0.02）%比<0.01（<0.01，<0.01）%，均P<0.05〕。
结论重症肺炎患者肠道菌群发生紊乱，表现为丰度及多样性下降，菌群群落结构发生改变，有益共生菌属减少，致病菌属增多，可能与重症肺炎疾病的发生发展有关。