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癫痫患者的细胞免疫和体液免疫功能在服用抗癫痫药前后均可能出现程度不等的紊乱表现。尤其有意义的是，在癫痫患者血清内可以检测到多种自身抗体，已证实其中有些自身抗体能够在动物体上引发ＥＥＧ棘波和／或癫痫样发作，提示自身免疫可能参与某些类型癫痫的发病。ＨＬＡ系统的研究揭示了癫痫伴发免疫功能紊乱可能有着更深刻的背景。癫痫的免疫调节辅助治疗仍处于探索阶段。