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TRIPS协议将医药产品纳入专利保护范围以后，引发了国际社会对药品专利和公共健康二者利益如何平衡的争执。本文在浅述药品专利保护与公共健康双方争端由来的基础上，浅谈了争执双方的利益所在，然后从社会价值、知识产权制度的利益衡平目标等方面分析后，笔者认为，在当前公共健康不断受到AIDS、SARS、禽流感等高发传染性疾病的挑战的情况下，应在保护药品知识产权的同时，不断加强对公共健康的保护。