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按照财政部颁布的《事业单位会计制度》规定，事业单位用专款拨入的基本建设资金，应通过“拨入专款”账户核算，对于事业单位基本建设资金来源于自筹部分也规定了核算办法，设置了“结转自筹基建”账户，专门核算事业单位经批准用财政补助收入资金以外安排的自筹基本建设所筹集并转存建设银行的资金，但在实际操作过程中，存在着一些问题。