【摘 要】
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目的 全面掌握贵州及周边省市狂犬病病毒(RABV)的遗传进化特征和分群特点,了解狂犬病疫苗株与流行株的分子遗传差异,为贵州狂犬病疫情的预防和控制提供指导依据.方法 搜索Gen
【机 构】
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贵州省疾病预防控制中心传染病防制所, 贵阳,550003云南大学生命科学学院, 昆明,650091;
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目的 全面掌握贵州及周边省市狂犬病病毒(RABV)的遗传进化特征和分群特点,了解狂犬病疫苗株与流行株的分子遗传差异,为贵州狂犬病疫情的预防和控制提供指导依据.方法 搜索GenBank数据库中贵州及周边5个省市具有明确时间、地区及宿主信息的流行毒株,对其糖蛋白基因(G)全序列进行汇总,并结合本实验室获得的贵州毒株和国内现役疫苗株G序列,利用MEGA和BEAST软件分别进行系统进化和时间进化分析.结果 贵州及周边省市79株RABV均属于基因1型,9个类群的RABV流行株具有明显的地域特征,11株疫苗株分化为2个类群;RABV流行株与疫苗株G基因核苷酸和氨基酸同源性分别为0.827～0.999和0.713～0.998;贵州及周边省市RABV流行毒株的最近共同祖先(TMRCA)可追溯至150年前.结论 贵州及周边省市流行的RABV优势毒株群仍属于基因1型,但毒株经过多年流行已经出现了分化,有必要对流行毒株与疫苗株的遗传变异一致性进行深入研究.
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