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目的：应用 ITS2序列快速并准确地鉴定中药材苍耳子，为其药材质量、用药安全提供保障。方法：提取苍耳子药材及其混伪品的基因组DNA、扩增 ITS2序列并测序，采用软件CodonCode Aligner V 4.2对测序峰图进行校对拼接，并对峰图进行质量控制。应用MEGA 5.0软件计算种内种间 Kimura 2-parameter （K2P）遗传距离,构建邻接（NJ）系统聚类树。结果：苍耳子药材基原物种种内 K2P 遗传距离为0，药材基原物种与其他混伪品的 K2P遗传距离分布于0.009-0.542；NJ