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在反刍动物的瘤胃内栖息着复杂、多样、非致病的各种微生物,包括瘤胃细菌、厌氧真菌和瘤胃原虫,还有少数噬菌体.瘤胃内容物中细菌为105~108万个·mL-1,原虫为10~102万个·mL-1,真菌为0.1~10万个·mL-1.不同种或品种的反刍动物瘤胃微生物的种类和数量存在着差异,从而也影响宿主对饲料的消化率.