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人体肠道内存在数量庞大、结构复杂的正常菌群，肠壁中存在数量众多的淋巴细胞，机体通过肠道黏膜与肠道中微生物相互作用，这些微生物包括定植于肠道中的以及机体摄入的。机体以肠黏膜为界，两者相互作用，相互制约，处于动态平衡状态。正常肠道菌群在促进免疫系统发育，维持正常免疫功能，协同拮抗病原菌入侵方面发挥重要作用。