【摘 要】
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目的 分析贵州省柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)分离株的基因特征. 方法 2015-2016年分离自贵州省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)患者的5株CVA6,采
【机 构】
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贵州省疾病预防控制中心,贵州贵阳,550004
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目的 分析贵州省柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)分离株的基因特征. 方法 2015-2016年分离自贵州省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)患者的5株CVA6,采用RT-PCR进行VP1区基因扩增并测序,通过MEGA7.0软件采用邻位相接法(neighbor joining method)构建遗传进化树,分析VP1区基因特征,通过1000bootstrap值评估其可靠性. 结果 5株CVA6贵州分离株之间的的核苷酸与氨基酸同源性分别为94.2％～100％和97.3％～100％,与原型株Gdula株之间的核苷酸同源性与氨基酸分别为81.8％～83.1％,和94.5％～95.7％;5株CVA6均为F基因型,其中1株(MF45512)为F2基因亚型,另外4株为F3基因亚型. 结论 2015-2016年贵州省CVA6流行株为F2和F3基因亚型,以F3基因亚型为主.
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