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针对GMSK调制通信系统中,传统MLSE均衡技术存在的对定时偏差较为敏感的问题,给出一种新型的分数间隔均衡方案.该方案的算法结构并不是传统的匹配滤波加白化滤波器的结构,而是基于改进型Viterbi算法（MVA）.该方案较好地解决了传统MLSE均衡对定时偏差敏感的问题.仿真分析表明,相比于传统的MLSE均衡,所提出的分数间隔均衡方案可以有效地改善均衡效果,同时在同频干扰下性能优良.