头痛，特别是继发性头痛的原因极其复杂，病变可隐藏在身体不同部位，和患者甚至和医生玩着捉迷藏。只有把隐藏在暗处的原发病揪出来并加以治疗，头痛才能彻底消失。
　　非血管性颅内疾病头痛
　　
　　颅内压升高 维生素A摄取过量、系统性红斑狼疮、阿狄森病(慢性肾上腺皮质功能减退)都可使颅内压升高，出现头部钝痛或脑核心部疼痛(俗称“脑浆”痛)。早期检查很难和这些疾病联系起来，查眼底可能出现视乳头水肿。如长期头痛经CT、磁共振排除脑肿瘤，应当考虑与上述情况有关。
　　低脑脊液压综合征 起立时头痛激烈．卧位时减轻，应去医院检查脑脊液压。如低，则应由医生检查原因进行治疗。
　　其他 白塞综合征、类肉瘤病、癌性腦膜炎等可引起慢性颅内病变，出现慢性头痛，并随着原发病轻重而减轻或加重。
　　
　　内环境紊乱引起的头痛
　　
　　低氧和高二氧化碳血症 动脉血中氧分压低于9．31千帕，或二氧化碳分压超过6．0千帕时，即可出现头痛，如高山病、低氧血症和呼吸系统痰病。
　　代谢性疾病 除低血糖可引起头痛外．有30％甲状腺功能减退患者也可出现头痛。
　　透析引起的头痛 透析中的患者经常出现头痛，可能与血压或渗透压变化有关。
　　
　　五官疾病与头痛
　　
　　青光眼 发病早期常因头痛激烈而就诊。除头痛外，常伴有羞明、视力下降、恶心、呕吐等症状，严重时可见角膜充血、浮肿和浑浊。急性青光眼必须早期诊断和治疗，否则可导致失明。
　　眼眶真菌感染 免疫功能下降的患者，可以引起眼眶真菌感染，表现为头痛和视力下降。
　　其他 眼肌炎、散光、斜视等也能引起慢性头痛。副鼻窦炎和副鼻窦波及的脑膜炎、脑脓肿以及牙龈炎、下颌关节炎等，都有慢性头痛症状。