【摘 要】
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为鉴定糯玉米品种的真实性，探究糯玉米品种间的亲缘关系。本研究以国内市场上推广的39份糯玉米品种为试材，利用基于靶向测序基因型检测（genotyping by target sequencing, GBTS）技术进行SNP （single nucleotide polymorphisms, SNP）标记检测，并开展DNA指纹图谱构建和NJ聚类分析。结果表明，在39份品种中获得6 397个SNP基因分
【机 构】
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中国热带农业科学院湛江实验站广东省旱作节水农业工程技术研发中心
【基金项目】
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中国热带农业科学院基本科研业务费专项（1630102017002; 1630062020032）资助；
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为鉴定糯玉米品种的真实性，探究糯玉米品种间的亲缘关系。本研究以国内市场上推广的39份糯玉米品种为试材，利用基于靶向测序基因型检测（genotyping by target sequencing, GBTS）技术进行SNP （single nucleotide polymorphisms, SNP）标记检测，并开展DNA指纹图谱构建和NJ聚类分析。结果表明，在39份品种中获得6 397个SNP基因分型数据，根据基因型完整度和次要等位基因频率（minor allele frequency,MAF）筛选了4 767个SNP位点，平均杂合率为33.94%；缺失率平均值为0.54%;MAF值分布在0.054～0.500之间，平均值为0.260；多态性信息含量（polymorphism information content, PIC）分布在0～0.375之间，PIC平均值为0.28，为中度多态性位点；39份糯玉米品种的SNP杂合率为20.62%～29.94%，平均值为26.79%，具有较高的杂合度；通过筛选PIC值大于0.37的25个SNP位点，可完全区分39个品种，鉴定率100%；基于4 767个SNP的聚类分析结果表明，39个品种被划分为5大类群。本研究结果可为糯玉米品种鉴定、自交系选育提供理论和技术支持。
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