中国辣椒热胁迫转录因子的全基因组鉴定及热胁迫响应的初步分析

来源 :植物科学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：javaname39

【摘要】

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采用生物信息学方法,从中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)全基因组序列中鉴定得到28个热胁迫转录因子(HSF)候选基因,并对这些候选基因的染色体分布、基因结构及编码蛋白的3D

【作者】

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高崇伦黄家权成善汉汪志伟尹黎燕

【机构】

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海南大学生命科学与药学院,海南大学热带作物学院,海南大学园艺学院

【出处】

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植物科学学报

【发表日期】

：

2020年2期

【关键词】

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中国辣椒热胁迫转录因子基因家族 Capsicum chinenseHeat stress transcription factorGene family

【基金项目】

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国家重点研发计划(2018YFD1000800),国家自然科学基金项目(31760578),海南大学高层次人才启动基金(KYQD1656)

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采用生物信息学方法,从中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)全基因组序列中鉴定得到28个热胁迫转录因子(HSF)候选基因,并对这些候选基因的染色体分布、基因结构及编码蛋白的3D结构特征进行了分析。结果显示:28个候选基因的编码蛋白长度为128~526 aa;系统发育分析结果表明,HSF可分为A、B、C 3个亚家族。进一步对热胁迫处理后的中国辣椒种质进行转录组分析,共检测到27个HSF转录本,与对照组相比,实验组中有25个基因对热胁迫有不同程度的响应。

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