可变剪接在肺腺癌预后中的价值

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目的:探讨可变剪接在肺腺癌预后中的作用。方法:在TCGA数据库中收集474例肺腺癌组织的RNA-seq数据,绘制可变剪接图谱;通过单因素Cox回归分析确定肺腺癌中存活相关的剪接事件,再利用最小绝对收缩模型筛选用于监测存活的预后因子;收集5例肺腺癌患者的癌组织,采用PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1的mRNA亚型条带。结果:在肺腺癌中存在着大量的可变剪接事件并与预后相关,包括CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1,通过生物信息学利用可变剪接事件构建了高效
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