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基于经验模态分解（EMD）的希尔伯特黄变换（HHT）方法能够较好地分析非平稳和非线性的信号。在EMD分解过程中易产生模态混淆现象，影响了信号分析结果的准确性。本文通过对EMD分解过程进行改进，在分解进程中增加滤波手段有效抑制了模态混淆现象，应用仿真信号实例进行对比分析表明抑制效果明显。最后，应用该改进方法对大坝强震反应信号进行分析，研究大坝在强震下特性变化规律。