基于Miseq测序技术分析不同元胡产区土壤细菌功能基因组成与差异

来源 :浙江中医药大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:drally
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[目的]分析元胡道地产区和非道地产区根际土壤细菌功能基因的组成和差异,在基因层面上探究根际土壤细菌对元胡生长的影响。[方法]将同一种源的元胡分种在不同产区,在收获期采集其根际土,Miseq测序检测元胡根际微生物及功能基因组成,与COG以及KEGG数据库进行比对。[结果]陕西非道地产区和浙江道地产区根际细菌组成种类相似,组成丰度在优势菌中差异明显:门水平上酸杆菌门、厚壁菌门浙江组较高,变形菌门、拟杆菌门浙江组较低;属水平上酸杆菌属Gp1浙江组较高,鞘氨醇单胞菌属、疣微菌某属浙江组较低。根际细菌功能基因经CO
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