磷酰化对丙氨酸与溶菌酶相互作用的影响(英文)

来源 :物理化学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:engineer2007
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在电喷雾离子阱质谱图中发现丙氨酸不能和溶菌酶形成二聚体, 而磷酰化丙氨酸(DIPP-Ala)能和溶菌酶形成二聚体. 进一步研究发现丙氨酸及其他氨基酸磷酰化后, 自身形成二聚能力大大增强. 在SiliconGraplics 图形工作站上采用SYBYL6.8 软件, 利用Tripos力场和分子力学方法研究了DIPP-Ala 最低能量构象, 并用分子对接(DOCK)研究了二聚体的形成. 结果说明磷氧双键的存在增强了分子间的相互作用. Alanine was found not to dimerize with lysozyme in electrospray ion trap mass spectrometry, whereas phosphorylated alanine (DIPP-Ala) was able to form dimers with lysozyme.A further study found that alanine and other After phosphorylation of amino acids, self-forming dimerization ability was greatly enhanced.Using SYBYL6.8 software on SiliconGraplics workstation, the lowest energy conformation of DIPP-Ala was studied by Tripos force field and molecular mechanics method, and molecular docking (DOCK) Dimer formation.The results show that the existence of the double bond of oxygen and oxygen enhances the intermolecular interaction.
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