【摘 要】
：
目的 采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探索阿尔茨海默病(AD)相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释.方法 从GEO数据库下载转录组测序数据,根据基因的相关性,当关联系数阈值设定为0.85时,参数β=8,以此构建基因共表达网络;采用Pearson相关性检验计算模块基因与临床表型相关性,筛选出与AD显著相关的基因模块,根据模块内的连接性筛选枢纽基因;利用GO功能富集分析和KEGG通路分析对模块进行功能注释.进一步建立β-淀粉样蛋白(Aβ1-42)诱导SH-SY5Y细胞损伤模
【机 构】
：
中国人民解放军军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所,北京 100850;中国人民解放军总医院第二医学中心老年医学研究所,国家老年疾病临床医学研究中心,北京 100853
论文部分内容阅读
目的 采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探索阿尔茨海默病(AD)相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释.方法 从GEO数据库下载转录组测序数据,根据基因的相关性,当关联系数阈值设定为0.85时,参数β=8,以此构建基因共表达网络;采用Pearson相关性检验计算模块基因与临床表型相关性,筛选出与AD显著相关的基因模块,根据模块内的连接性筛选枢纽基因;利用GO功能富集分析和KEGG通路分析对模块进行功能注释.进一步建立β-淀粉样蛋白(Aβ1-42)诱导SH-SY5Y细胞损伤模型,在模型组和对照组中检测枢纽基因的表达水平.结果 根据基因表达的相关性,共构建了10个基因共表达模块,其中brown和turquoise模块与AD组显著相关(brown:r=0.66,P<0.001;turquoise:r=-0.68,P<0.001);结果 显示48个基因在共表达网络中处于核心地位;通过生物注释功能发现,两模块中的基因主要富集在DNA损伤修复通路和代谢相关通路等生物学过程中.基因的差异表达分析显示,DNASE1、TEKT2、MTSS1L等基因在AD组中高表达,ACP2、LANCL2、GMPR2等基因在AD组中低表达;体外实验进一步验证了在Aβ1-42诱导的SH-SY5Y细胞损伤过程中DNASE1、TEKT2、MTSS1L表达上调(P<0.01),ACP2、LANCL2、GMPR2表达下调(P<0.01).结论 brown和turquoise模块与AD高度相关,并从模块中筛选出MTSS1L、GMPR2、ACP2、ACTG1、LANCL2等枢纽基因,可能通过调节DNA损伤和修复参与AD发病机制.
其他文献
目的 探究口服沙库巴曲缬沙坦联合芪苈强心胶囊合并心衰常规治疗对慢性心力衰竭患者LVEF和NT-proBNP水平的影响.方法 选取2017年1月至2020年1月本院收治的120例慢性心力衰竭及合并心衰患者,随机分为对照组与观察组,各60例.两组均进行心衰常规治疗,在此基础上,对照组采用沙库巴曲缬沙坦治疗,观察组在对照组基础上联合芪苈强心胶囊治疗.比较两组临床疗效,LVEF、NT-proBNP改善程度及预后各评分改善情况.结果 观察组治疗总有效率高于对照组(P<0.05);治疗后,观察组LVEF高于对照组,N
目的 探究阿卡波糖片联合二甲双胍治疗2型糖尿病患者的疗效和安全性.方法 选取2019年6月至2020年6月本院收治的2型糖尿病患者72例,根据治疗方法的不同分为单用组和联用组,各36例.单用组给予二甲双胍片治疗,联用组在单用组基础上联合阿卡波糖片治疗,比较两组临床疗效、血糖控制情况(空腹血糖、餐后2 h血糖、糖化血红蛋白)及对患者肝、肾功能(BUN、AST、U-MA、Cr)的影响.结果 治疗后,联用组空腹血糖、餐后2 h血糖、糖化血红蛋白均显著低于单用组(P<0.05);联用组治疗总有效率显著高于单用组(
目的 探讨扁桃体腺样体切除术对儿童阻塞性睡眠呼吸暂停/低通气综合征的疗效.方法 选取2018年5月至2020年5月本院收治的儿童阻塞性睡眠呼吸暂停/低通气综合征患儿60例,随机分为研究组与对照组,各30例,对照组应用常规治疗,研究组应用扁桃体腺样体切除术治疗.比较两组圣乔治呼吸问卷评分、血氧饱和度、AHI次数、最长呼吸暂停时间、治疗后血清免疫球蛋白水平.结果 研究组圣乔治呼吸问卷评分低于对照组(P<0.05);研究组血氧饱和度明显高于对照组,AHI次数显著少于对照组,最长呼吸暂停时间显著短于对照组(P<0
目的 探讨腹腔镜胆囊切除术(LC)对胆囊结石合并急性胆囊炎患者肝功能及应激指标的影响.方法 回顾性分析2017年3月至2019年12月本院收治的68例急性胆囊炎患者的临床资料,按照治疗方法的不同分为两组,各34例.对照组采用小切口胆囊切除术治疗,观察组采用LC治疗,比较两组肝功能及应激指标.结果 术后,两组总胆红素(TBIL)、谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)、直接胆红素(DBIL)、间接胆红素(IBIL)水平均高于术前,但观察组低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);术后,两组促肾上腺皮
目的 探究肺磨玻璃结节CT征象在早期肺腺癌诊断中的价值.方法 选取2018年1月至2020年5月本院收治的经CT检查存在肺磨玻璃结节征象患者54例作为研究对象,按照病理结果分成良性组与恶性组,各27例,所有患者均进行CT机检查.比较两组肺磨玻璃结节不同CT影像特点,分析诊断价值.结果 两组肺磨玻璃样结节病变形状、边界、毛刺征、血管集束征、支气管充气征、分叶征、胸膜凹陷征、空泡征、密度等征象比较差异有统计学意义(P<0.05);胸膜凹陷征诊断敏感性、特异性最高(P<0.05);边界粗糙诊断敏感性、特异性最低
目的 探讨3D打印模型及术前规划辅助治疗Dupuytren骨折的临床疗效.方法 选取2017年2月至2019年10月本院手术治疗Dupuytren骨折患者84例,采用随机表法分为基础组(传统手术,n=42)和干预组(3D打印模型及术前规划辅助手术治疗,n=42),比较两组围手术期指标、手术相关并发症及踝关节功能.结果 干预组手术时间、住院时间均短于基础组,术中出血量少于基础组(P<0.05).干预组内固定不稳定发生率显著低于基础组(P<0.05).干预组踝关节功能优良率高于基础组(P<0.05).结论 3
目的 探究NE与TP对急性呼吸窘迫综合征伴感染性休克患者容量反应性与血流动力学指标的影响.方法 选取2019年2月至2020年2月本院收治的30例急性呼吸窘迫综合征伴感染性休克患者为研究对象,采用单双号随机分为两组,各15例.对照组采用去甲肾上腺素治疗,观察组采用特利加压素治疗.比较两组平均动脉压(MAP)、心率(HR)、尿量、输入量、血肌酐(SCr)、乳酸、不良反应发生率.结果 治疗后,观察组MAP高于对照组,HR低于对照组(P<0.05);治疗后,观察组尿量、输入量均多于对照组(P<0.05);治疗后
目的 探讨替格瑞洛与氯吡格雷对冠心病患者PCI术后炎症细胞因子水平及心血管不良事件的影响.方法 选取2017年6月至2019年12月于本院行PCI术治疗冠心病患者100例,采用随机数字表法分为两组,各50例.对照组采用氯吡格雷治疗,研究组采取替格瑞洛治疗.比较两组微循环指标水平、炎症细胞因子水平、心血管不良事件及不良反应发生率.结果 术前,两组微循环指标、炎症细胞因子水平比较差异无统计学意义;术后1个月,研究组冠状动脉血流储备分数(CFR)、微循环阻力指数(IMR)高于对照组,肿瘤坏死因子α(TNF-α)
目的 分析血小板参数联合骨髓涂片对血液疾病检验的临床效果.方法 选取2019年2月至2020年2月本院收治的90例血液疾病患者作为研究对象,按疾病类型的不同分为急性白血病组(AL组)、特发性血小板减少性紫癜组(ITP组)和再生障碍性贫血组(AA组),每组30例;同期选取30例在本院体检的健康者作为对比组,均给予血小板参数和骨髓涂片检验,比较各组的血小板参数[血小板平均体积(MPV)、血小板计数(PLT)、血小板压积(PCT)]变化、巨核细胞数及类型、骨髓增生程度,比较骨髓涂片结果中各组的血小板分布情况.结
目的 分析醒脑开窍针刺法联合康复训练治疗脑卒中偏瘫患者的临床疗效.方法 选取2018年8月至2020年8月本院收治的108例脑卒中偏瘫患者为研究对象,随机抽签分为两组,各54例.对照组仅开展康复训练,观察组在对照组基础上联合醒脑开窍针刺法治疗,比较两组患肢运动功能、治疗不同时间生活质量.结果 治疗6周后,观察组上肢、下肢运动功能评分均高于对照组(P<0.05);治疗6周后,治疗结束后2、6周,观察组生活质量评分均低于对照组(P<0.05).结论 醒脑开窍针刺法联合康复训练治疗脑卒中偏瘫可更明显改善肢体功能