尾巨桉HMGR基因的克隆及表达分析

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【摘要】

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基于RACE技术克隆得到尾巨桉3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶（EuHMGR）基因全长为1955bp,包含1560bp的开放阅读框（ORF）,编码519个氨基酸。生物信息学分析表明EuHMGR包含两个HMG-CoA

【作者】

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蒋春张华玲彭江

【机构】

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四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,西南大学生命科学学院三峡库区生态环境教育部重点实验室

【出处】

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广西植物

【发表日期】

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2012年1期

【关键词】

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尾巨桉 HMGR 生物信息学内含子组织特异性表达 Eucalyptus urophyla×E.grandis HMGR bioinformat

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基于RACE技术克隆得到尾巨桉3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶（EuHMGR）基因全长为1955bp,包含1560bp的开放阅读框（ORF）,编码519个氨基酸。生物信息学分析表明EuHMGR包含两个HMG-CoA结合基序和两个NADP（H）结合基序;同源建模得到EuHMGR三维构象呈＂V＂型,包含N-结构域、S-结构域和L-结构域。将EuHMGR组DNA与cDNA序列进行比对表明EuHMGR存在一个319bp的内含子。通过实时定量PCR进行组织特异性表达分析表明EuHMGR在茎中的表达量最高,叶次之

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