【摘 要】
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目的 掌握云南省4个口岸地区(金水河、磨憨、清水河、姐告)黄胸鼠种群遗传多样性和亲缘关系.方法 对2014-2015年在4个口岸地区捕获的55只黄胸鼠进行解剖,取其肝脏组织进行基
【机 构】
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中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所,北京100176云南国际旅行卫生保健中心,云南昆明650228;
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目的 掌握云南省4个口岸地区(金水河、磨憨、清水河、姐告)黄胸鼠种群遗传多样性和亲缘关系.方法 对2014-2015年在4个口岸地区捕获的55只黄胸鼠进行解剖,取其肝脏组织进行基因组DNA提取.应用PCR技术分析其线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因,通过生物信息学分析软件(Clustal X 2.0和MEGA 7.0)分析Cytb基因序列.计算Cytb基因序列的核苷酸、密码子组成以及使用频率,分析遗传距离并采用邻接法(Neighbour-Joining,NJ)构建系统进化树.结果 Cytb基因序列中碱基组成A+T约占59.77％,C+G约占40.23％.密码子UCA、CUA、CCA的使用频率分别为3.19％、3.11％和3.09％.姐告和清水河口岸黄胸鼠Cytb基因的遗传距离为0.000;金水河与清水河、姐告口岸黄胸鼠Cytb基因的遗传距离均为0.008.以小家鼠、褐家鼠为外群构建NJ进化树,清水河与姐告聚为一支,其次与磨憨,最后与金水河聚为一支.结论 Cytb基因序列中A+T含量明显高于C+G含量,黄胸鼠Cytb基因可能存在A+T偏倚性.遗传距离和NJ进化树分析表明清水河与姐告口岸黄胸鼠亲缘关系较近,其次是与磨憨黄胸鼠;金水河黄胸鼠与其他3个口岸黄胸鼠的亲缘关系较远.
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