【摘 要】
：
水稻抗白叶枯病基因Xa1是一个能对日本白叶枯病优势小种产生专化抗性的R基因,曾被广泛应用于水稻的抗性育种研究.为深入了解Xa1家族成员及其特征,本研究通过生物信息学对Xa1
【机 构】
：
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南省农业生物技术重点实验室,农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,昆明,650223
论文部分内容阅读
水稻抗白叶枯病基因Xa1是一个能对日本白叶枯病优势小种产生专化抗性的R基因,曾被广泛应用于水稻的抗性育种研究.为深入了解Xa1家族成员及其特征,本研究通过生物信息学对Xa1类成员进行系统鉴定,并分析其基本结构特征、染色体定位、序列变异以及系统进化关系等相关特性.结果显示,共鉴定到34个成员,它们都来自稻属植物,这些成员成簇分布在水稻4号染色体上.基本结构特征分析结果表明,Xa1家族成员的DNA、mRNA和CDS长度,以及内含子、外显子和氨基酸数量等偏差较大,但氨基酸残基组成差异不明显;多样性分析发现,氨基酸保守性低,密码子偏好性不强,核苷酸和氨基酸遗传变异较丰富,但大多的变异为无义突变;根据进化关系将家族成员分为五类,其中第五类成员包括LOC102719767共1个基因,它们位于系统树基部,为Xa1类基因进化的祖先类群.本研究初步分析了 Xa1基因家族的特征,为后期从中发掘功能性抗白叶枯病基因提供理论支持.
其他文献
目的 对低位产钳助产术助产指征及并发症情况进行分析,思考低位产钳助产术在分娩中的价值.方法 将我院2019年4月-2021年3月纳入的120例产妇作为观察对象,据助产方式不同将产
目的 分析临床医学检验中血液细胞检验质量控制方法.方法 以分组方式展开本次研究(随机数表法分组),抽取体检中心100例结果为健康的实验人员,在2020年1月～2020年12月获得体检
目的 探讨对门诊肺结核患者采取门诊分诊的应急策略.方法 选取2019.10-2020.10期间在我院门诊就医的532例疑似肺结核患者,对所有患者均开展门诊分诊应急方案,观察其治疗期间
目的 评价延续护理在中医药治疗多囊卵巢综合征患者中的作用.方法 120例接受中医药治疗的多囊卵巢综合征患者随机分为试验组及对照组,对照组常规治疗及随访,试验组给予延续护
目的 讨论优质护理在高血压脑出血患者中的临床应用效果.方法 70例高血压脑出血患者(2019年3月至2020年3月),根据统计推断法分组,各35例.参照组以传统护理为主,观察组以优质
目的 分析快速康复护理措施在接受手术治疗的老年泌尿系统疾病患者中的应用效果.方法 以在我院接受手术治疗的老年泌尿系统疾病患者140例为本实验研究对象,采用计算机随机分
S4UR(Small auxin-up RNA)基因作为生长素信号早期响应基因,在调控植物生长发育以及对逆境胁迫的应答中扮演着关键角色.本研究通过染色体步移法从杉木基因组DNA中获得了ClSAU
为分析蒙古韭叶绿体基因组密码子的使用模式,本研究通过高通量测序获得了蒙古韭叶绿体基因组序列,从中筛选出52条蛋白编码序列(codingsequence,CDS),利用CodonW 1.4.2和在线
生长调控因子(grow regulating factor, GRF)是重要的植物转录因子之一,在调控植物生长发育过程中发挥重要作用.本研究通过生物信息学分析,从大麦基因组中鉴定出12个HvGRF转
目的 分析头孢哌酮舒巴坦联合阿奇霉素治疗伴细菌感染老年重症肺炎的临床效果.方法 以我院伴细菌感染老年重症肺炎患者(2019年1月-2019年12月90例)为研究对象,采用随机抽签法