癌症相关microRNA与靶基因的生物信息学分析

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Micro RNAs(mi RNAs)是一类长度约为22nt的内源性非编码RNA,通过与靶基因转录本互补结合调控基因的表达。近年来,研究发现mi RNA与癌症发生密切相关,mi RNA可以直接充当癌基因或者抑癌基因而影响肿瘤的发生和生长。为更进一步揭示癌症相关mi RNA的特征及靶基因的功能,文章通过数据库搜索及文献检索,在人类基因组中发现了475个癌症相关mi RNA,系统地比较了癌症相关mi RNA与非癌症mi RNA以及基因内和基因间区癌症相关mi RNA在保守性、SNP位点分布、癌谱及转录调控等特性。研究发现,癌症相关mi RNA比非癌症mi RNA保守性要强,发生SNP概率比较低,同时发现mi RNA所涉及癌症数目与保守性成正相关。基因组定位分析发现,癌症相关mi RNA比非癌症mi RNA更倾向于成簇存在。进一步对宿主基因、癌症相关mi RNA及作用的靶基因与癌症发生进行关联分析,发现一些非癌症mi RNA的宿主基因倾向于被癌症mi RNA作用。本研究结果为深入理解mi RNA与癌症之间的关系,以及进一步为mi RNA作为癌症诊断指示物提供理论依据。
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