分子对接技术预测丹酚酸B对TGF-β/Smads信号通路的潜在作用靶点

来源 :广东药科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:samfl
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目的 利用分子反向对接方法,探索丹酚酸B在TGF-β/Smads通路中的潜在作用靶点,为研究丹酚酸B干预上皮-间充质转化与纤维化机制提供参考依据。方法 通过查阅文献寻找与TGF-β/Smads信号通路有关的药物靶点,构建TGF-β/Smads信号通路蛋白靶点结构数据库,在计算机上使用分子对接软件AutoDockVina,把丹酚酸B和结构数据库中的蛋白分子进行反向分子模拟对接,根据丹酚酸B和各个靶点蛋白亲和力分数高低和对接构象相互作用的大小,筛选出潜在的靶点蛋白。结果 根据 AutoDockVina构象结合打分结果进行分析,分数最佳的是Snail(2y48)和Axin(2x39),均为-10.9分。Chimera构象检视显示Snail的结构优于AXIN,从得分总体情况分析,Axin优于Snail。结论 推测Snail、Axin可能为丹酚酸B潜在的药物作用靶点蛋白。
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