黄瓜抗霜霉病相关EST-SSR的信息分析

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对霜霉病菌诱导的黄瓜cDNA文库测序获得的3091条ESTs进行分析,经过除前处理和拼接后得到2507条Unigenes。应用生物信息学方法,对黄瓜抗霜霉病相关EST—SSRs的分布频率和碱基重复特点进行了归纳及分析..结果表明,2507条Unigenes中共检索到231个EST—SSR,出现频率为7.47%,平均分布距离为4.58kb。EST—SSRs包括51种重复单元,以二核苷酸和三核苷酸重复基元为主,二者分别占总SSRs的59.74%和34.63%.在EST中的总出现频率分别为4.46%和2.59%
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