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在构建区域自主创新能力指标体系的基础上,利用因子分析法初步找出了影响河南省自主创新能力的六大主因子：创新资金投入能力、成果产出能力、创新人才素质、创新的环境、创新投入产出率及自主创新成果产业化水平。结合河南省情,提出应该进一步提高自主创新的资金投入强度、进一步提高自主创新成果产出能力、进一步加大自主创新人才培养力度、进一步促进自主创新成果产业化、进一步扩大外商投资力度、进一步提高自主创新投入产出率等措施。