生菜生长调节因子互作因子GIF基因家族的鉴定与分析

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生长调节因子互作因子GIF (GRF-Interacting Factor)是植物中一类转录共激活因子,可以与生长调节因子(Growth-Regulating Factor, GRF)形成功能复合体,在植物生长发育等过程中发挥重要作用。生菜是重要的叶用蔬菜,叶片的生长发育直接影响到生菜的品质及产量。生菜中GIF基因家族的特性及生物学功能至今尚未有研究报导。基于生菜全基因组序列数据和生物信息学方法,本研究在生菜中鉴定到5个GIF基因,系统进化分析将它们分为两个亚家族。LsaGIFs均含有4个外显子,并不均匀地分布在4条染色体上,CDS长度在546~837 bp范围内,推测编码蛋白的氨基酸残基为181~278个,蛋白的N端均含有保守的SNH结构域。本研究还对LsaGIFs的三级结构和顺式作用元件进行了系统分析,为后续探究生菜GIF基因的功能及GRF-GIF调控网络的研究奠定了基础。
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