中国HCV5'-非编码区复合酶切分型及其3b基因型序列分析

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目的研究中国丙型肝炎病毒(HCV)不同基因型感染分布情况,并对3b序列进行分析. 方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT -PCR)技术扩增HCV5NCR 1a、1b、2a、2b、3a、3b、4a、6a不同基因型的cDNA及187份HCV RNA阳性样品中cDNA.A应用BHH (BsrB I、HaeⅡ、Hinf I)复合内切酶消化5′-NCR cDNA,B应用BstUⅠ消化,C应用HaeⅢ消化,电泳检测片段大小.结果 187例HCV RNA阳性患者A B C分型结果表明,1b型感染率占67.38%,2a型12.30%,1b/2a 型为5.88%,3b型 5.35%,2b型3.21%,2a/2b、1b/2b型各为2.14%,1a型1.07,6a型0.54%.3份3b基因型5-NCR A-T克隆测序结果表明,3株3b型之间同源性为99.54%~100%.其中chiKQ50与GI514395 3a株为96.28%与GI676877 3b株同源性为98.6%,与1a型为93.49%,与1b型为94.88%,与2a型为91.63%,与2b型为89.30%,与4a型为95.35%,与6a型为93.4%,结论研究结果表明该项分型技术既保证了RT- PCR检测灵敏度,又具有良好的分型效果.提示:该分型方法不仅适合中国HCV基因型检测,对亚洲及欧洲和非洲HCV分型研究也具有一定的参考价值.
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