基于SAPSO-LSSVM的蛋白质模型质量评估

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针对传统蛋白质模型质量评估没有考虑同源信息的问题,提出了一种基于LS-SVM评估蛋白质模型质量的方法.综合模扭退火(simulated annealing,SA)算法跳出局部最优解和粒子群(particle swarm optimization,PS0)算法收敛速度快的特点,提出了模拟退火粒子群(SAPSO)算法.利用SAPSO算法来优化LS-SVM参数C和Y最后得到最优模型来评估蛋白质模型质量.实验结果表明,经SAPSO优化LS-SVM参数所得到的模型评估预测误差较小,且预测值更稳定.
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