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2004年的法人化改革开启了日本国立大学制度建设的新纪元,改革六年来日本国立大学系统发生了深刻变化,大学理念从“自在”逐步走向“自为”,文部科学省与大学关系从“直接控制”转变为“间接控制”,大学内部决策程序从“自下而上”革变为“自上而下”,教师身份从“公务员”突变为“雇员”。这些具有历史转折意义的改革给我们的启示是,现代大学制度外部关系建设的核心是健全法人制度,内部关系建设的重点是完善运行机制,协调内外部关系的中介是构建社会评价与监督机制。