目的为了解三明市各区县疾病预防控制机构(CDC)人员、财物、检测能力等基线水平,发现存在的问题,为加强基层疾病预防控制体系建设提供本底资料。方法收集2010-2011年福建省三明市12个区县疾病预防控制中心编制数、在职人员数、技术职称构成、技术职务构成、学历构成、现从事专业构成等,采用统计学方法“秩和比法(RSR法)”综合评价。分析2003-2012年福建省三明市各区县疾病预防控制中心人力综合素质情况及实验室主要仪器装备情况,采取统计学卡方检验方法比较出不同年度间以上项目是否有统计学显著性差异。结果三明市区县疾病预防控制体系相当薄弱,编制偏少,无技术职称者平均达21.23%,本科学历者仅13.86%,实验室面积占比例仅31.77%,工资福利支出近37.91%,万元设备总值平均仅104.75万。10年人力综合素质均值总体呈逐年上升趋势,但仍不足,平均编制数仅28.25。高级职称仅占13.35%,中级职称仅占33.22%,无学士学位比例高达86.14%。实验室主要仪器装备呈逐年上升的趋势,2012年达到平均63.75项,根据区县级疾控中心实验室配备仪器标准共197项,三明地区明显不足。结论加强三明市区县疾病预防控制体系建设既非常重要,又刻不容缓,查明其人、财、物的基线水平明显偏低,为今后加强基层疾病预防控制体系建设提供了依据。