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针对预警机指挥控制系统中的威胁估计问题，提出了一种基于补偿直觉模糊神经网络（CIFNS）的威胁估计方法。把目标的动态信息和静态信息相结合，将一般模糊推理推广到直觉模糊推理，建立了基于CIFNS的目标威胁估计网络结构和威胁判断模型，给出了相应的网络学习算法，对算法应用于预警机指控系统威胁估计的情况进行了仿真。结果表明，基于CIFNS的估计算法具有较快的收敛速度和良好的自适应性。