论文部分内容阅读
序列比对是生物信息学中最常用和最经典的研究手段。生物序列比对需要有强大计算能力的硬件支撑，而近年快速发展起来的GPGPU正好可堪此任。本文首先介绍GPGPU的发展过程，进而讲述GPGPU硬件设备与其编程环境，然后对GPGPU做科学计算时需要的数学库函数做一介绍，最后综述近年来国内外基于GPGPU的生物序列比对软件和相关研究工作，并总结和展望其辉煌前景。