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为了增强微卫星标记检测遗传多样性的图谱清晰度；同时，增强不同引物之间扩增条件的一致性和提高工作效率，我们建立并优化了荧光标记多重PCR技术。结果证明：通过这种方法可以显著提高条带的判别效率；增强图谱的清晰度；由于减小了不同引物之间扩增条件的差异，可使不同的引物扩增图谱放在一起进行综合分析。另外用ABI3100序列分析仪来分析微卫星扩增产物，大大减少了工作量，提高了判断基因型的准确性。本文以中国黄牛的遗传多样性检测为例，比较了荧光多重PCR技术的优缺点和限制因素。