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以中国新疆伊犁地区的巩留县莫合镇库尔德宁、新源县交吾托海、霍城县大西沟和塔城地区的裕民县巴尔鲁克山4个种下居群的109个新疆野苹果实生株系为材料，利用8对苹果SSR引物进行群体遗传结构的研究。结果表明：8对SSR引物在4个居群中可平均扩增出16条带，其中巩留县居群多态性带数百分比最高为89．06％，各位点平均Nei基因多样度为0．257．4个群体共扩增出128个位点，在种级水平及巩留县、新源县、霍城县和裕民县4个居群水平多态性位点百分比分别为100％、88．28％、84．38％、87．50％、78．12％