【摘 要】
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为了解川、渝、黔地区猪圆环病毒3型（PCV3）的感染现状及流行毒株的分子遗传特征,本试验对2020年1月至2021年1月期间3省市共30个区县639份临床样本进行了检测,对阳性样本进行全基因组测序并与国内外毒株比对分析.结果显示,共检测到7份阳性样本,整体阳性率1.10%.5份阳性样本（重庆3份、四川1份、贵州1份）经过测序拼接,发现病毒全基因组长度均为2000bp,Gen Bank登录号分别为O
【基金项目】
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贵州省科技支撑资助项目“贵州省规模猪场重要免疫抑制性传染病流行情况调查及综合防制示范与推广应用”（2020G1Y032）；
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为了解川、渝、黔地区猪圆环病毒3型（PCV3）的感染现状及流行毒株的分子遗传特征,本试验对2020年1月至2021年1月期间3省市共30个区县639份临床样本进行了检测,对阳性样本进行全基因组测序并与国内外毒株比对分析.结果显示,共检测到7份阳性样本,整体阳性率1.10%.5份阳性样本（重庆3份、四川1份、贵州1份）经过测序拼接,发现病毒全基因组长度均为2000bp,Gen Bank登录号分别为OK334614～OK334618,同源性比对显示与国内外毒株的相似性在98.2%～99.2%之间,与PCV2和PCV4的同源性较低,分别为44.9%～45.5%和46.3%～46.9%.通过对Cap蛋白的氨基酸序列分析,发现重庆和四川地区4份样本感染毒株的基因型均属于PCV3a型,而贵州地区样本感染毒株的第24和27位氨基酸分别为亮氨酸（L）和赖氨酸（K）,为一种新的变异基因型,不属于目前分类标准下的任何一种.该结果为进一步了解PCV3的遗传变异及其在我国西南部分省份的分子流行特征提供了依据.
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