基于支持向量机递归特征消除和特征聚类的致癌基因选择方法

来源 :厦门大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:qq20881010
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癌症通常由基因发生突变引起,因此从大量基因中有效地识别出少量致癌基因具有重要意义.针对基因表达谱数据高维小样本的特点,将支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)和特征聚类算法相结合,提出一种新的基因选择方法:K类别SVM-RFE(K-SVM-RFE).该算法通过特征排序算法去除大量无关基因,利用K均值聚类算法将相似基因聚为一类,并通过两次SVM-RFE算法精选致癌基因.随后将K-SVM-RFE算法应用于多个基因表达谱数据集,并对其中的关键参数设置进行了讨论.实验结果表明K-SVM-RFE算法所选基因较已有
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