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薯蓣科基本上是一个热带科，广布于世界热带地区，共有９属，约６５０种。热带亚洲（尤其云贵高原－横断山一带）很可能是该科的原始分布与分化中心，热带美洲及热带非洲则可能是２次生分布与分化中心。其起源时间可追溯到白垩纪或更早。现代分布格局的形成主要是由于联合古陆的发裂、第四纪冰川的破坏及其自身的一些生物学特性所决定的。