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本研究使用３０对微卫星引物，对１４个不同类型及来源的水稻基因型材料进行ＳＳＲ片段长度的多态性分析，并运用自动荧光测序系统精确检测ＳＳＬＰ片段的长度，结合ＧｅｎｓＳｃａｎ２．１和Ｇｅｎｏｔｙｐｅ２．０分析软件进行数据输出和图象处理，得到了多态性丰富的微卫星标记。可以利用这些标记区别和鉴定不同类型和来源的水稻种质材料，并进行亲源关系的比较和遗传距离的估计。