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在建立苹果品种AFLP分析体系的基础上，从68对引物中筛选出了4对多态性高、分辨能力强的引物（即P32M46、P44M53、P59M41和P79M61）。分析了P32M46引物绘制的我国25个苹果重要品种的AFLP指纹图谱的遗传多样性，确定了各供试品种的差异带，区分子供试的25个苹果品种。对AFLP分析的关键步骤进行了讨论，并对生产上应用AFLP技术检测苹果品种真实性和纯度作了展望。