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为评估台湾茶树种原之遗传歧异性。本研究由100条ISSR引子申筛选出12条可产生多型性条带明显的引子．这些引子共可产生67个的多型性条带。依据每一种原之分子标志数据进行UPGMA法分群分析结果。可将台湾133个茶树种原区分成六大群，包括油茶群、赤芽山茶群、野生茶树群、大叶变种与小叶变种混合群、大叶、小叶及大叶、小叶杂交种混合群及小叶变种群。而主成分向量分析的结果与利用群聚分析得到的亲缘关系树形固结果相符合。台湾茶树种原高比例的遗传歧异度是由台湾的野生茶树所贡献．部分重要栽培种间的相似性仍极高。为了探讨制茶