禽流感病毒H9N2亚型分离株HA基因的克隆及序列分析

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以禽流感病毒地方株A/chicken/Mudanjiang/0823/2000(H9N2)的总RNA为模板,用通用反转录引物和自行设计的一对特异性引物,采用RT-PCR方法扩增了HA基因.测序及序列分析结果表明:HA基因全长1 707 bp,编码560个氨基酸残基,与GenBank收录的H9N2亚型的核苷酸同源性最高达99%,最低为87.23%;氨基酸同源性最大达98.04%,最低为88.57%.经HA裂解位点附近的氨基酸序列分析表明,CMJ/00毒株为低致病力毒株.
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