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针对自组织映射算法在衡量神经元与输入数据之间相似度时将所有特征视为权值相同,导致无法在基因半监督聚类中利用限制信息的某些重要特征的不足,提出了一种新的基于基因限制信息的特征权值优化算法。算法根据限制信息优化特征的权值,将那些能够有效区分限制信息的特征赋予较大的权值。为防止在特征权值的优化中引入偏置或对非限制数据划分能力减弱,算法利用非限制信息调整特征权值。实验结果表明,算法提高了基因聚类的准确率。