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微囊藻是分布最广的一类水华蓝藻,研究、建立微囊藻的快速检测方法具有十分重要的意义。针对藻蓝蛋白的基因间隔区域序列设计了一组可用于检测微囊藻种属的特异性探针,以实验室培养的微囊藻Microcystis aeruginosa为研究对象,建立了一种检测微囊藻的夹心杂交法。将该法用于华中科技大学校园内的景观湖———镜湖水样的检测,结果与显微镜观察和全细胞PCR的结果一致,表明试验建立的方法是有效的。