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目的
查明引起内蒙古自治区呼伦贝尔市鼠类感染肾综合征出血热(HFRS)的病毒基因型及亚型。
方法2014年春季在呼伦贝尔市莫力达瓦旗HFRS疫区捕获啮齿类宿主动物,对捕获的宿主动物进行分类鉴定。取90只鉴定后的鼠进行无菌解剖取肺组织,提取RNA,用实时荧光定量反转录PCR(Real-Time RT-PCR)扩增汉滩型病毒(HTNV)、汉城型病毒(SEOV)及普拉马病毒(PUUV),对扩增结果为阳性标本以反转录PCR(RT-PCR)法扩增部分S基因片段,将目的片段测序且与已知病毒序列进行系统发生分析并分型。
结果呼伦贝尔市HFRS疫区是以姬鼠型为主的混合疫区,捕获鼠类共10种362只,鼠类平均密度为13.92%(362/2 600)。野外以黑线姬鼠为优势鼠种(占43.21%,70/162),其次为大林姬鼠(占34.57%,56/162);居民区以褐家鼠为优势鼠种(占40.50%,81/200),其次为黑线姬鼠(占31.50%,63/200)。在90份鼠肺组织中,23份鼠肺样品检测到汉坦病毒(HV),且均为HTNV。对10株部分S片段核苷酸产物进行序列测定,均为HTNV的H6亚型。
结论引起内蒙古自治区呼伦贝尔市鼠类感染HFRS的病毒基因型为HTNV,其S基因亚型为H6。