针对现阶段农民专业合作社与技术供给主体间合作中存在的"貌合神离、名存实亡"的现象,在合作双方间只能达成不完全契约的现实基础上,将合作主体的行为分为积极合作和消极合作两种,构建了两方主体间的演化博弈模型来分析主体间不同合作程度选择下的合作演化过程和结果,发现在多因素作用下会出现多种合作状态的形成。基于此,文章探讨了正式契约中的利益分配与政府规制对于合作中双向隐性机会主义行为的缓解作用,结果表明,仅依赖正式契约的激励机制,其缓解效果是有限的,而政府规制下的基于合作效益提升程度差异化政策奖励的方式是矫正合作主体行为的有效补充。总的来说,隐性机会主义行为的治理需要合作双方与第三方主体共同努力,通过合作的信任机制与外部的矫正与监督机制双管齐下,才能实现农民专业合作社技术合作创新的稳定和发展。