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丙型肝炎病毒（HCV）非结构蛋白NS3共有631个氨基酸组成，具有丝氨酸蛋白酶和三磷酸核苷酶（NTPase）和螺旋酶（Helicase）的功能，在HCV多聚蛋白的成熟和病毒复制过程中发挥重要作用。非结构蛋白NS3具有较强的免疫原性和抗原性，是检测HCV感染的主要抗原之一。近年的研究发现NS3内部的裂解产物更具有致癌潜能。此外，NS3蛋白还参与NS5A的超磷酸化修饰过程等。