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在自然保护区，巡护是保护自然资源最基础、最重要的手段。太白山自然保护区根据总体规划，编制了《巡护计划》，制定了巡护管理考核制度与办法，并根据太白山自然保护区复杂的地理环境与人为活动情况，按照区域样线划分原则在区内共设计16条、总里程239公里的固定巡护样线。在此基础上，多年来积极开展日常样线巡护和稽查巡护工作，有效地保护了区内动植物资源安全。